DNA甲基化標(biāo)志物：預(yù)測(cè)胃癌

2018-05-24 來(lái)源：基因谷標(biāo)簽：掌上醫(yī)生喝茶減肥一天瘦一斤安全減肥 cps聯(lián)盟美容護(hù)膚

摘要：特殊標(biāo)志物，比如ELMO1在兩個(gè)患者組都表現(xiàn)出高識(shí)別率。然而，其它標(biāo)記，包括ARHGEF4，由于橫跨正常組和患者組的背景，識(shí)別率更具多樣。

美國(guó)胃腸病學(xué)院提交的一項(xiàng)研究新研究表明，在美國(guó)和韓國(guó)的隊(duì)列中，多個(gè)甲基化DNA標(biāo)志物可以準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)胃癌。

“在這項(xiàng)研究中，我們通過(guò)全甲基化測(cè)序鑒定了新的甲基化DNA標(biāo)志物，隨后在美國(guó)和南韓的患者隊(duì)列中確認(rèn)了最佳候選，”Bradley W.Anderson博士（梅奧診所）在演講中提到。

來(lái)自美國(guó)35名患者和韓國(guó)50名患者的17份甲基化DNA標(biāo)志物候選具有完整的腺癌，Anderson和同事們對(duì)其進(jìn)行了評(píng)估，并與對(duì)照組進(jìn)行比較。美國(guó)組是與65名健康患者的正常胃黏膜上皮細(xì)胞對(duì)比。50名韓國(guó)患者在首爾大學(xué)醫(yī)院接受治療，作為自身對(duì)照組。據(jù)Anderson所說(shuō)，在基線時(shí)取鄰近的正常粘膜做樣本。

對(duì)每一個(gè)標(biāo)記物，應(yīng)用邏輯回歸分析計(jì)算曲線下面積（AUC）。來(lái)自顯微組織的DNA是通過(guò)甲基化特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行分析，通過(guò)β肌動(dòng)蛋白對(duì)標(biāo)志物水平標(biāo)準(zhǔn)化。

研究人員發(fā)現(xiàn)，前10位的DNA標(biāo)記包括ARHGEF4，ELMO1，ABCB1，CLEC11A，ST8SIA1，SFMBT2，CD1D，CYP26C1，ZNF569和C13ORF18。

這10個(gè)標(biāo)志物檢測(cè)出美國(guó)組胃癌率為100%，南韓檢測(cè)率為94%，其特異性為95%。

美國(guó)隊(duì)列各標(biāo)志物的AUCs分別為ARHGEF4：0.92；ELMO1：0.91；ABCB1：0.89；CLEC11A：0.88；ST8SIA1：0.85；SFMBT2：0.82；CD1D：0.82；CYP26C1：0.81；ZNF569：0.75；C13ORF18：0.66。

南韓隊(duì)列各標(biāo)記的AUCs分別為ARHGEF4：0.73；ELMO1：0.9；ABCB1：0.78；CLEC11A：0.75；ST8SIA1：0.8；SFMBT2：0.94；CD1D：0.87；CYP26C1：0.79；ZNF569：0.75；C13ORF18：0.79。

“這些標(biāo)志物準(zhǔn)確性高，而且一些標(biāo)記在兩組的判別中相似，”Anderson說(shuō)。

特殊標(biāo)志物，比如ELMO1在兩個(gè)患者組都表現(xiàn)出高識(shí)別率。然而，其它標(biāo)記，包括ARHGEF4，由于橫跨正常組和患者組的背景，識(shí)別率更具多樣。

“在美國(guó)組和南韓組中，研究人員鑒定出對(duì)胃癌具有高敏感性和特異性的有益甲基化DNA標(biāo)志物，Anderson總結(jié)說(shuō)。“將這些候選甲基化DNA標(biāo)志物批準(zhǔn)用于早期胃癌，還需要進(jìn)一步研究。”