陰道上皮內瘤樣變可無癥狀或僅有陰道分泌物增多和(或)接觸性陰道出血，體征上陰道黏膜可無異常或僅輕度糜爛。需注意的是，行婦科檢查時，窺陰器需旋轉，以便看清整個陰道黏膜，不然的話，在窺陰器葉片下的組織會被遺漏而漏診。
陰道上皮內瘤樣變無特殊的癥狀和體征，診斷主要靠：
1.陰道脫落細胞涂片檢查是陰道上皮內腫瘤初步篩選的有效方法。凡是陰道細胞學涂片異常，應排除該異常細胞是否來自宮頸或外陰。
2.當陰道細胞學出現異常時，需行陰道鏡檢查。陰道鏡下常可發(fā)現陰道上皮出現白色鑲嵌狀、點滴狀和微粒狀的表現。
3.凡陰道黏膜上有明顯的病灶，可直接行活檢送病理檢查。如陰道黏膜無明顯異常，可在陰道鏡或碘液涂抹陽性處行活檢送病理檢查。
陰道上皮內瘤樣變是通過病理來進行診斷，按其程度分為3級。
VAINⅠ：扁平上皮下l/3層細胞增生，輕度異型性，極性存在，核分裂象少見，中、上層細胞分化成熟。
VAINⅡ：扁平上皮下2/3層以內的細胞有中度異型性，極性稍紊亂，核分裂象多見，上1/3層內的細胞成熟。
VAINⅢ：扁平上皮下2/3層以上的細胞重度異型性，極性喪失，核分裂多，可見不典型核分裂，細胞邊界不清。當發(fā)展到整個上皮層為不典型增生時則為原位癌。

陰道上皮內瘤樣變應與以下疾患鑒別，但由于下述疾病均可有輕度不典型增生，它們與腫瘤性的非典型增生之間在細胞學和病理上均難以區(qū)分，故鑒別診斷的關鍵在于定期行陰道涂片檢查或病理檢查，以其發(fā)展趨勢來判定。
1.陰道炎或陰道上皮萎縮 癥狀與體征往往與陰道上皮內腫瘤雷同，主要靠病理檢查鑒別。病檢表現為：炎癥時，見細胞增生，同時由于細胞質內糖原減少，核漿比例增大，但整個細胞極性保持，核分裂少，且多在深層。
2.人乳頭狀瘤病毒感染 此類感染的癥狀和體征與陰道上皮內腫瘤常無區(qū)別。其病理表現為細胞不典型增生位于中、淺層，并出現挖空細胞。