巨指(趾)的發(fā)病機理目前仍在研究中，沒有形成定論。此病和多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤有關(guān)。認為骨膜上神經(jīng)的多發(fā)神經(jīng)纖維瘤導致了骨破壞和再生，并主張多發(fā)神經(jīng)纖維瘤是局限性的快速生長的唯一原因。但是，報道了13例病人，沒有一個有臨床或組織學上的多發(fā)神經(jīng)纖維瘤的特征。于是，為了把兩者聯(lián)系起來，用“不完全性多發(fā)神經(jīng)纖維瘤”來定義巨指畸形。 　　還有一種觀點認為是脂肪瘤的變異。這個理論很有吸引力 ，因為巨指(趾)都表現(xiàn)出纖維脂肪組織的增生，巨指中更為顯著的特征是肥大，扭曲的掌神經(jīng)及其分支在巨趾中很少見。但是，受累的手指大部分都發(fā)生在掌側(cè)，故神經(jīng)源學說仍不能被完全否定。曾報道了一個同時患巨指和巨趾癥的病例，其巨指中神經(jīng)受累，而巨趾中卻沒有發(fā)現(xiàn)神經(jīng)異常。所以，最新的觀點是代表的，雖然巨趾的主要損害是過度增殖蓄積的脂肪組織，巨指的損害是神經(jīng)，但是，不管它們的基本損害是什么，最終的結(jié)果是生長抑制因子的缺乏或局部內(nèi)因子的表達，導致了手指或足趾的所有成分的過度生長。