算命這件事可謂歷史悠久,從商代的占卜,到文王拘而演周易,一直延續(xù)到世紀初打著高科技名義坑蒙拐騙的“電腦算命”。
不過像奇點糕這樣,接受了馬克思主義教育的共產(chǎn)主義接班人,自然是不會相信這些封建迷信的。“算命”最大的意義恐怕就是給我們留下了商代的甲骨文,讓我們可以一窺4000年前祖先的生活。
不過現(xiàn)在,這一封建迷信的傳統(tǒng)領域也部分地被科學攻克了。近日,哈佛醫(yī)學院的AmitKhera和SekarKathiresan等,通過全基因組評分,成功預測了冠心病、房顫、2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌這5種疾病的發(fā)病風險[1]。文章發(fā)表在《自然遺傳學》上。
說起基因和疾病,奇點糕首先想到的就是高中生物課里學的各種紅綠色盲、血友病、白化病等等遺傳病。這些遺傳病有個共同特點,都是單基因遺傳,也就是它們的發(fā)病都只和一個基因的異常有關,測一個基因就能知道會不會得病了。
不過,大多數(shù)的疾病都是多個基因,再加上環(huán)境因素共同作用的造成的。比如在帕金森中,最常見的LRRK2突變也只占了全部發(fā)病人數(shù)的3%[2]。在2型糖尿病中,最常見的HNF1α突變也只能解釋2.1%的患者[3]。
而像冠心病,流行病學調查顯示40-60%的易感性是遺傳因素帶來的[4],全基因組關聯(lián)性也發(fā)現(xiàn)了33個和冠心病有關的基因,每個基因突變都會不同程度地增加冠心病的風險[5]。比如,遺傳性高膽固醇血癥突變,一種出現(xiàn)率0.4%的突變,會使冠心病的風險增加3倍[6]。
影響因素這么復雜,研究起來自然很難。不過還好,測序技術和計算機技術的成熟,使得獲得和處理大量樣本成為可能,也讓對多基因遺傳病的預測研究可以開展。
“我們很久以前就知道,整體基因變異情況是一些疾病的高危因素”通訊作者SekarKathiresan說,“現(xiàn)在,我們能夠使用基因組數(shù)據(jù)來衡量這種風險。從公共衛(wèi)生的角度來看,我們需要確定這些高危人群,以便提供適當?shù)念A防措施。”
在2006年,威康信托醫(yī)療慈善機構、醫(yī)學研究理事會、衛(wèi)生部、蘇格蘭政府和西北地區(qū)發(fā)展署共同建立了英國生物銀行。在2006到2010年間,英國生物銀行一共招募了50萬名年齡在40至69歲之間的志愿者,收集了血液、尿液和唾液樣本,并在之后跟蹤他們的健康狀況。
這些數(shù)據(jù)正好可以用于多基因遺傳病的研究。
AmitKhera等首先根據(jù)以往的數(shù)據(jù),為冠心病建立了31個全基因組多基因評分(GPS)模型,然后從英國生物銀行中抽取120280名志愿者的數(shù)據(jù),對這些模型進行了測試。
研究人員對評分和發(fā)病率作圖,根據(jù)曲線下面積(AUC)對這些模型進行評價,選取出最好的一個模型,再用英國生物銀行中,另外抽取288978名志愿者的數(shù)據(jù)對其進行驗證。
在驗證隊列中,通過這個多基因評分模型,研究人員發(fā)現(xiàn)有8%的人患冠心病的風險比普通人高3倍多,是之前根據(jù)遺傳性高膽固醇血癥這一個基因突變找出的高危人群的20倍。而比普通人冠心病風險高4倍和5倍的分別有2.3%和0.5%。
“對于心臟病發(fā)作,我預測每個病人在不久的將來都有機會知道自己的多基因風險指數(shù)——就像他們現(xiàn)在知道自己的膽固醇指數(shù)一樣。”通訊作者Kathiresan博士表示。
接下來,研究人員又用同樣的方法對房顫、2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌進行了分析。
對于房顫,多基因預報模型發(fā)現(xiàn)有6.1%的人有3倍風險,而評分最高的1%的人有4.63倍的風險。至于2型糖尿病、炎癥性腸病和乳腺癌,分別有3.5%、3.2%和1.5%的人有3倍風險。
當然,光找出易感人群是不夠的,還要有針對性的預防措施。比如冠心病,課題組之前的研究顯示,通過健康的生活方式,以及服用他汀類藥物降低血脂,是可以抵消掉基因帶來的冠心病風險的[7-9]。
Kathiresan博士說:“我們將多基因風險評分作為一種方法,在出生時識別出疾病的高風險或低風險人群,然后使用這些信息來針對性干預,無論是通過生活方式的改變還是治療。”
不過研究人員也指出,他們的研究是基于歐洲人的,如果用于其他人群,可能還需要做進一步的驗證。此外,這樣的基因檢測會不會造成“基因歧視”也是個值得思考的問題。
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