1.急性胃腸炎 潛伏期約1～2天，癥狀多較輕，低熱或不發(fā)熱，腹瀉呈水樣稀便，有腹痛而無里急后重，個別患者腹瀉嚴重類似霍亂。2歲以下兒童可表現(xiàn)為痢疾樣癥狀。大部分病例經(jīng)2～5天自愈，重癥可持續(xù)1～2周。
2.外傷感染 因皮膚傷口接觸河水、污泥而感染。輕者僅有局部潰瘍，重者可發(fā)生蜂窩織炎。
3.敗血癥 患者有嚴重慢性疾病時，本菌可由傷口或腸道侵入血流。嗜水氣單胞菌感染敗血癥可并發(fā)感染性心內(nèi)膜炎、壞死性肌炎、內(nèi)眼病變和遷徙性膿腫等。
4.其他感染 本菌偶可引起術(shù)后感染、尿路感染、褥瘡感染、膽囊炎、腹膜炎、肺炎、腦膜炎、壞死性肌炎和骨髓炎等。
根據(jù)腹痛、腹瀉、低熱等，參考流行病學(xué)資料，結(jié)合糞便培養(yǎng)親水氣單胞菌陽性，可作出診斷。其他類型感染根據(jù)臨床表現(xiàn)及血或分泌物等培養(yǎng)陽性作出診斷。

胃腸型需與其他病原引起的腹瀉相鑒別，敗血癥型需與傷寒和基礎(chǔ)疾病本身引起的發(fā)熱相鑒別。