致病性自生生活阿米巴性角膜炎患者多為年輕的健康人，男女比例均等，多數(shù)有角膜接觸鏡配戴史或眼外傷史。絕大多數(shù)為單眼受累，個別患者也可雙眼發(fā)病，起病一般比較緩慢。炎癥早期主要表現(xiàn)為角膜上皮的不規(guī)則，上皮粗糙或反復上皮糜爛，有時可表現(xiàn)為假樹枝狀改變?；颊叱Ｓ忻黠@的眼痛，其程度往往超出體征，形成“癥狀與體征分離”的現(xiàn)象。
隨著病情發(fā)展，炎癥逐漸侵及基質(zhì)層，形成角膜前基質(zhì)層的斑狀、半環(huán)狀或環(huán)狀浸潤。有些病變類似于盤狀角膜炎的改變，部分患者可有放射狀角膜神經(jīng)炎。
如未得到及時診斷與治療，角膜浸潤很快發(fā)展成角膜潰瘍、基質(zhì)膿腫，并有衛(wèi)星灶形成和前房積膿，嚴重者發(fā)生角膜壞死穿孔。如果角膜潰瘍累及到角膜緣，常導致角膜緣炎，甚至鞏膜炎。
嚴重的病例中，有20%以上發(fā)生白內(nèi)障，尤其在病情遷延、角膜移植術(shù)后、以及長期滴用過糖皮質(zhì)激素的病例。
棘阿米巴原蟲可以與細菌、真菌及病毒混合感染?；旌细腥镜募毦饕斜砥て咸亚蚓⒔瘘S色葡萄球菌、鏈球菌屬及短棒菌苗。
棘阿米巴角膜炎的診斷主要依靠臨床表現(xiàn)和實驗室檢查，角膜刮片進行棘阿米巴原蟲培養(yǎng)是比較常用的一種檢查方法。

致病性自生生活阿米巴性角膜炎，早期須與單孢病毒性角膜炎的上皮病變型相鑒別。此時誤診率較高，對初次發(fā)病的上皮性病變、有遷延不愈傾向，同時有外傷或角膜接觸鏡配戴史的患者要高度懷疑，并及時行角膜刮片細胞學檢查，有利于鑒別診斷。當角膜基質(zhì)浸潤及潰瘍形成時，要與單孢病毒性盤狀角膜炎、細菌及真菌性角膜炎相鑒別，眼部劇烈的疼痛史或放射狀角膜神經(jīng)炎的出現(xiàn)都有助于鑒別診斷。近年來角膜共焦顯微鏡的應(yīng)用，為棘阿米巴性角膜炎的早期快速診斷提供了新的手段。通過角膜共焦顯微鏡，可在活體角膜中觀察到棘阿米巴包囊，有助于臨床診斷。但共焦顯微鏡檢查陰性，并不能完全否定臨床診斷。